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メールの受信プロトコルには IMAP と POPの２つの方式があります（従来のp.u-tokyo.ac.jpはPOPのみ選択可）。簡単にいえば、IMAPはサーバに保存されているメールを見に行く方式です。ですから、どの端末からも同じ環境でメールを見ることができますが、メールアプリケーションにメールは保存されません。

POPはメールアプリケーションにメールが保存されます。メールアプリケーションに保存したメールは「メールをサーバに残す」設定にしない限りは、メール受信後に、メールサーバから削除されます。